Sus obras más importantes fueron completadas tras la disolución de la URSS. A partir de 1992, comenzó a trabajar intensivamente en lo que sería una historia de siete volúmenes sobre la oposición revolucionaria marxista, encabezada por León Trotsky, a la degeneración estalinista de la URSS.
Cubriendo el periodo de 1923 a 1940, ¿Hubo una alternativa? de Rogovin es un estudio histórico sin par, indispensable para entender el régimen estalinista y la arraigada oposición socialista a su traición de los principios y programas de la Revolución de Octubre.
Rogovin documentó la inmensa popularidad de Trotsky, incluso después de su exilio de la Unión Soviética en 1929, y estableció que el principal propósito del terror sangriento de Stalin en los años treinta fue erradicar la influencia política de Trotsky.